An integrative bioinformatics and experimental approach identifies a novel cell death index and prognostic biomarkers in acute myeloid leukemia.

Opis bibliograficzny

An integrative bioinformatics and experimental approach identifies a novel cell death index and prognostic biomarkers in acute myeloid leukemia. [AUT.] ZHANSHU LIU, KATARZYNA KOTWICA-MOJZYCH, FARRUKH NISAR MUHAMMAD, [AUT. KORESP.] JING LUO. J. King Saud. Univ. Sci. [online] 2026 vol. 38 nr 5 [art. nr] 15022025, s. 1-12, bibliogr. poz. 35, [przeglądany 7 lipca 2026]. Dostępny w: https://jksus.org/an-integrative-bioinformatics-and-experimental-approach-identifies-a-novel-cell-death-index-and-prognostic-biomarkers-in-acute-myeloid-leukemia/. DOI: 10.25259/JKSUS_1502_2025
Skopiowane!
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Źródło:
Journal of King Saud University - Science [online] 2026 vol. 38 nr 5, [art. nr] 15022025, s. 1-12, bibliogr. poz. 35.
Rok:2026
Język:angielski
Charakter formalny:Artykuł w czasopiśmie
Typ MNiSW/MEiN:Praca Oryginalna

Streszczenia

In this comprehensive study, a robust methodology to investigate the regulatory effects of ENO1 and DDIT4 gene silencing on cell proliferation and apoptosis, underscoring their critical roles in cancer biology. Genes linked to programmed cell death (PCD) across 12 distinct PCD patterns were collated from multiple sources, resulting in a final set of 1078 genes analyzed for their involvement in apoptosis, pyroptosis, and other cell death pathways. Functional enrichment analyses conducted through DAVID and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) pathways yielded insights into the molecular functions and biological processes influenced by these genes. Key analyses included the use of ssGSEA to calculate cell death scores and unsupervised clustering to identify patterns in acute myeloid leukemia (AML) samples, which revealed significant associations with patient prognosis. A cell death index (CDI) through the least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) Cox regression model, validated across different cohorts, and demonstrated predictive value for patient outcomes. Experimental assessments further confirmed the role of ENO1 and DDIT4 in modulating apoptosis, where gene silencing demonstrated significant effects on cell death and proliferation markers like BCL2, Caspase-3, FAS, and BAX. These findings were supported by flow cytometry assays, which quantitatively assessed apoptosis in U937 and MV411 cells, thereby reinforcing the genes’ roles in cancer pathology. Furthermore, the study investigated the interface between CDI and immune cell infiltration, demonstrating that CDI correlates with immune landscape alterations within the tumor microenvironment (TME), thus also suggesting potential implications for immunotherapy responsiveness. Collectively, the study provides a multi-dimensional view of how specific genes influence cell death mechanisms and their broader implications in cancer therapy and prognosis.

Open Access

Tryb dostępu:otwarte czasopismoWersja tekstu:ostateczna wersja opublikowanaLicencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa - Użycie niekomercyjne (CC-BY-NC); Czas udostępnienia:w momencie opublikowania

Identyfikatory

BPP ID: (27, 104975) wydawnictwo ciągłe #104975

Metryki

70,00
Punkty MNiSW/MEiN
3,300
Impact Factor
0
Punktacja wewnętrzna

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Skopiowane!

Punkty i sloty autorów

AutorDyscyplinaPkD / PkDAutSlot
Kotwica-Mojzych Katarzyna, dr n. med.nauki medyczne35,00000,5000

Punkty i sloty dyscyplin

DyscyplinaPkD / PkDAutSlot
nauki medyczne35,00000,5000

Informacje dodatkowe

Zewnętrzna baza danych:Scopus
Web of Science
Rekord utworzony:7 lipca 2026 13:16
Ostatnia aktualizacja:1 września 2026 14:11